桦剥管菌SRAP分子标记反应体系优化与遗传多样性分析

作者:彭木;王秋玉;闫绍鹏 刊名:中南林业科技大学学报 上传者:肖智仁

【摘要】桦剥管菌Piptoporus betulinus作为一种褐腐真菌,是白桦木材的专性腐朽菌,在工业污染物降解和医药领域中起着重要作用.以桦剥管菌为材料,在SRAP-PCR体系优化的基础上,对来自东北主要林区(带岭、塔河、帽儿山以及敦化)不同种群的桦剥管菌进行遗传多样性分析,为桦剥管菌多态性鉴定以及进一步利用提供理论依据.结果表明:用单因素法及均匀设计法优化后的SRAP-PCR体系为10×Buffer 2.0 μL、Primer 各8 μmol/L、dNTP 16 mmol/L、Taq polymerase 2.5 U、DNA 12 ng、Mg2+45 mmol/L,总体积20 μL;利用优化的反应体系筛选出15对引物,并扩增出239条清晰的条带,其中237条为多态性条带,多态性比率为99.16%;采用POPGENE软件分析,4个种群的平均有效等位基因平均数、平均Nei's多样性指数、平均Shannon多样性指数分别为1.4995、0.3030、0.4655;系统聚类结果显示,15个菌株分成了两个类群,这一结果表明来自同一地点菌株的遗传背景较为相似,揭示了桦剥管菌菌株间遗传特性与地理分布间的相互关系.

全文阅读

Vol. 38 No. 1 Jan. 2018 第 38 卷 第 1 期 2018 年 1 月 中 南 林 业 科 技 大 学 学 报 Journal of Central South University of Forestry & Technology 收稿日期:2016-10-18 基金项目:中央高校基本科研业务费专项(2572014CA22,2572017AA23) 作者简介:彭 木,硕士研究生 通信作者:闫绍鹏,高级工程师,博士;E-mail:ysp_4@126.com 引文格式:彭 木,王秋玉,闫绍鹏 . 桦剥管菌 SRAP 分子标记反应体系优化与遗传多样性分析 [J]. 中南林业科技大学学报,2018, 38(1): 29-36. Doi:10.14067/j.cnki.1673-923x.2018.01.006 http: //qks.csuft.edu.cn 木材腐朽菌是森林生态系统中森林微生物的重要组成部分,这类菌广泛地生长在各种树木的活立木、枯立木、倒木、伐桩、原木、枕木、板材及许多建筑用材上,因能引起木材腐朽而降低了木材的实用价值 [1]。桦剥管菌 Piptoporus betulinus 又称桦孔菌、桦滴孔菌,是桦木属树木专性木腐菌,造成木材褐色腐朽,在桦树天然林中较为常见。此外,该真菌在民间医药中被当作一种常见的抗寄生虫和抗菌剂,用于伤口和直肠癌等疾病的治疗,是一种非常有前途的医药资源。 桦剥管菌 SRAP 分子标记反应体系优化与遗传多样性分析 彭 木,王秋玉,闫绍鹏(东北林业大学 生命科学学院,黑龙江 哈尔滨 150040) 摘 要:桦剥管菌 Piptoporus betulinus 作为一种褐腐真菌,是白桦木材的专性腐朽菌,在工业污染物降解和医药领域中起着重要作用。以桦剥管菌为材料,在 SRAP-PCR 体系优化的基础上,对来自东北主要林区(带岭、塔河、帽儿山以及敦化)不同种群的桦剥管菌进行遗传多样性分析,为桦剥管菌多态性鉴定以及进一步利用提供理论依据。结果表明:用单因素法及均匀设计法优化后的 SRAP-PCR 体系为 10×Buffer 2.0 μL、 Primer 各 8 μmol/L、dNTP 16 mmol/L、Taq polymerase 2.5 U、DNA 12 ng、Mg2+ 45 mmol/L,总体积 20 μL;利用优化的反应体系筛选出 15 对引物,并扩增出 239 条清晰的条带,其中 237 条为多态性条带,多态性比率为 99.16%;采用 POPGENE 软件分析,4 个种群的平均有效等位基因平均数、平均 Nei’s 多样性指数、平均Shannon 多样性指数分别为 1.499 5、0.303 0、0.465 5;系统聚类结果显示,15 个菌株分成了两个类群,这一结果表明来自同一地点菌株的遗传背景较为相似,揭示了桦剥管菌菌株间遗传特性与地理分布间的相互关系。关键词:桦剥管菌;SRAP;反应体系优化;遗传多样性 中图分类号:S718.43 文献标志码:A 文章编号:1673-923X(2018)01-0029-08 Optimization of SRAP reaction system and genetic diversity analysis of Piptoporus betulinus from different populations PENG Mu, WANG Qiuyu, YAN Shaopeng (College of Life Sciences, Northeast Fo

参考文献

引证文献

问答

我要提问