中药化学数据库中HIV RT(NNRTI)/IN双靶点抑制剂的虚拟筛选

作者:肖泽云;李凯;李爱秀 刊名:天津中医药 上传者:牛爱红

【摘要】[目的]从天然产物中筛选人类免疫缺陷病毒(HIV)非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTI)和整合酶链转移抑制剂(INSTI)作用位点的双靶点抑制剂[RT(NNRTI)/IN].[方法]运用分子模拟技术和计算机辅助药物设计(CADD)方法,构建HIV RT(NNRTI)/IN双靶点抑制剂分子相似性搜索模型、NNRTI和RT以及INSTI和IN对接模型,采用两种策略对中药化学数据库(TCMD)进行筛选.[结果]共命中与RT和IN对接得分均大于6的化合物35个,包括黄酮类、生物碱类、苷类、多酚类等,黄酮类化合物(15个)占到了42.86%.[结论]黄酮类化合物是开发潜在HIV RT (NNRTI)/IN双靶点抑制剂的主要来源,上述研究为天然产物来源的HIV双靶点药物发现提供了新线索.

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天 津 中 医 药 Tianjin Journal of Traditional Chinese Medicine 2018 年 5 月第 35 卷第 5 期May 2018,Vol.35 No.5 中药化学数据库中 HIV RT(NNRTI)/IN双靶点抑制剂的虚拟筛选 * 肖泽云 1,李 凯 1,2,李爱秀 1,3 (1.武警后勤学院基础部药物设计实验室,天津 300309;2.武警山西总队医院药剂科,太原 030006; 3.天津市职业与环境危害防制重点实验室,天津 300309) 摘要:[目的] 从天然产物中筛选人类免疫缺陷病毒(HIV)非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTI)和整合酶链转移抑制剂(INSTI)作用位点的双靶点抑制剂[RT(NNRTI)/IN]。[方法] 运用分子模拟技术和计算机辅助药物设计(CADD)方法,构建 HIV RT(NNRTI)/IN 双靶点抑制剂分子相似性搜索模型、NNRTI 和 RT 以及 INSTI 和 IN 对接模型,采用两种 策略对中药化学数据库(TCMD)进行筛选。[结果] 共命中与 RT 和 IN 对接得分均大于 6 的化合物 35 个,包括黄酮类、生物碱类、苷类、多酚类等,黄酮类化合物(15 个)占到了 42.86%。[结论] 黄酮类化合物是开发潜在 HIV RT (NNRTI)/IN 双靶点抑制剂的主要来源,上述研究为天然产物来源的 HIV 双靶点药物发现提供了新线索。 关键词:天然产物;逆转录酶;整合酶;双靶点抑制剂;虚拟筛选 中图分类号:R2-03 文献标志码:A 文章编号:1672-1519(2018)05-0386-06 * 基金项目:国家自然科学基金项目(81241114,30472166); 天 津 市 科 技 攻 关 计 划 重 点 科 技 攻 关 专 项 基 金 资 助 项 目 (06YFGZSH07000);武警后勤学院研究生创新课题(WHYC2 01610,WHYC201605)。 作者简介:肖泽云(1992-),女,硕士在读,主要研究方向为计 算机辅助药物设计。 通讯作者:李爱秀,E-mail∶ liaixiu2006@126.com。 ·中药研究· 艾滋病(AIDS)是由人类免疫缺陷病毒(HIV)引起的一种复杂疾病,其治疗一直是医学难题。HIV 属于逆转录病毒,变异性强,在使用单靶点药物治疗 AIDS 的过程中,病毒容易产生耐药[1]。运用网络 药理学对复杂疾病进行网络分析,发现 AIDS 等复 杂疾病由多因素共同作用,其病理过程涉及多个细胞信号分子,仅针对单一细胞信号分子难以起到良 好的治疗效果。多靶点药物能够多途径调节疾病的 信号通路,同时作用于复杂疾病的多种细胞信号分 子,提高治疗效果 [2-3] 。目前,临床上采用多药多靶点 药物即“鸡尾酒”疗法(HAART)治疗 AIDS。但多药 联用毒副作用更大,容易引起不良反应,患者的依 从性 较 差 [1] 。 加 之 病 毒 交 叉 耐 药 的 产 生 ,影 响 了 HAART 的治疗效果,新型抗 HIV 药物的研发依然 紧迫。与多药多靶点药物相比,单药多靶点药物为 单一化学实体,药代动力学性质更好掌握,并且能够减少交叉耐药的发生。目前,虽然尚未有 HIV 单 药多靶点抑制剂进入临床研究阶段,但单药多靶点 药物已成为抗 HIV 创新药物的重要思路。 天然产物数量巨大,种类繁多,是研发新药和寻找先导化合物的重要来源。目前,在针对 AIDS 的 天然产物研究中,发现了其中不乏对 HIV 病毒具有 抑制作用的化合物。前期,总结了

参考文献

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