用基因芯片筛选高转移卵巢癌细胞系转移相关基因

作者:许沈华;牟瀚舟;顾琳慧;苏丹;朱赤红;刘祥麟 刊名:遗传学报 上传者:吴一斌

【摘要】用标准化的Affymetrix公司生产U133A基因芯片技术研究高(H)转移卵巢癌细胞株(HO-8910PM)和正常卵巢上皮(C)基因表达谱差异,筛选与卵巢癌转移相关的基因及其在染色体的定位和功能.结果发现高转移卵巢癌细胞株和正常卵巢上皮比较表达差异8倍以上共有1,237个基因,其中表达上调(信号比的对数值SLR≥3)有597个,表达下调(SLR≤-3)有640个.从表达差异的基因在染色体定位分析,发现除1个基因未知其定位外,其余所有差异表达基因分散在各条染色体上,但以1号染色体最多,有115个(9.3%).其次是2号染色体有94个(7.6%),第三是12号染色体有88个(7.1%).第四是11号染色体有76个(6.1%).第五是X染色体有71个(5.7%).第6是17号染色体有69个(5.6%).而差异表达的基因发生在染色体短臂(q)上有805个(占65.1%),在13,14,15,21和22号仅发现在q上有差异表达基因.从表达差异的基因分子功能分类看,属于酶和酶调控子基因最多(306个,占24.7%),其次是核酸结合基因(144个,占11.6%).第三类是信号传导基因(137个,占11.1%).第四类是蛋白结合基因(116个,占9.4%).以上4大类共占基因总数56.8%.还有功能未知的基因有207个,占16.7%.结论:高转移卵巢癌细胞株差异表达基因散在分布在各条染色体上,但以1、2、12、11、17和X染色体差异表达基因居多,肿瘤的转移是多基因共同作用的结果.4大类(酶和酶调控子活性、核酸结合活性、信号传导活性、蛋白结合活性)差异表达基因是我们今后研究卵巢癌转移相关的重要基因.

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